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ヒューリスティクスを併用したGPによるエクソン・イントロン境界の高精度判別
http://hdl.handle.net/10458/454
http://hdl.handle.net/10458/454884c6882-7b31-4bb1-8140-be9c57c6b387
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
KJ00004439529.pdf (1.1 MB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2007-06-28 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | ヒューリスティクスを併用したGPによるエクソン・イントロン境界の高精度判別 | |||||
| 言語 | ja | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Accurate Exon-Intron Boundary Identification by GP with Heuristics | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| キーワード | ||||||
| 言語 | en | |||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Exon, Intron, DNA sequence, Genetic Programming | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
| その他（別言語等）のタイトル | ||||||
| その他のタイトル | ヒューリスティクス オ ヘイヨウ シタ GP ニ ヨル エクソン イントロン キョウカイ ノ コウセイド ハンベツ | |||||
| 言語 | ja-Kana | |||||
| 著者 |
藤田, 祐司
× 藤田, 祐司× 山森, 一人× 吉原, 郁夫× 相川, 勝× Fujita, Yuji |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | ABSTRACT Genetic Programming (GP) is one of a method to identify exon-intron boundaries in gene sequences. In conventional method, bases are represented by 2- or 4-bits length binary codes and these bits are inde- pendently used as inputs to the identification model. Here we develop a method to generate exon-intron boundaries identify model by GP with the heuristics obtained by statistical characteristics. And our method can directly accept not the bit-encoded data, but the character data of bases. The heuristic is defined as the differences of appearance frequencies for bases around the "GT" and "AT", and they are abstracted from 8,000,000 base sequence data. We combined GP with heuristics to Generate identifica- tion model for Exon-Intron boundaries. |
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| 言語 | en | |||||
| 書誌情報 |
ja : 宮崎大学工学部紀要 en : Memoirs of Faculty of Engineering, University of Miyazaki 巻 35, p. 309-314, 発行日 2006-08-30 |
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| 出版者 | ||||||
| 出版者 | 宮崎大学工学部 | |||||
| 言語 | ja | |||||
| 出版者 | ||||||
| 出版者 | Faculty of Engineering, University of Miyazaki | |||||
| 言語 | en | |||||
| ISSN | ||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||
| 収録物識別子 | 05404924 | |||||
| 書誌レコードID | ||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||
| 収録物識別子 | AA00732558 | |||||
| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||
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Cite as
藤田, 祐司, Yamamori, Kunihito, 吉原, 郁夫, 相川, 勝, Fujita, Yuji, 2006, ヒューリスティクスを併用したGPによるエクソン・イントロン境界の高精度判別: 宮崎大学工学部, 309–314 p.
