@article{oai:miyazaki-u.repo.nii.ac.jp:00003199,
 author = {佐伯, 雄一 and Saeki, Yuichi and 園田, 亮一 and Sonoda, Ryoichi and 城, 惣吉 and Shiro, Sokichi and 矢野, 翼 and Yano, Tsubasa and 赤木, 功 and Akagi, Isao and 山本, 昭洋 and Yamamoto, Akihiro and Sugimoto, Yasuhiro and 杉本, 安寛 and 園田, 亮一 and Sonoda, Ryoichi and 城, 惣吉 and Shiro, Sokichi and 矢野, 翼 and Yano, Tsubasa and 赤木, 功 and Akagi, Isao},
 journal = {宮崎大学農学部研究報告, Bulletin of the Faculty of Agriculture University of Miyazaki},
 month = {Mar},
 note = {Domestic animal excrement is known as biomass resources for soil improvement material and manure, and methane fermentation process is known as a remarkable method other than composting as the animal waste management. In our previous study, the existence of pathogenic microbes was not identified about methane-fermentation liquid from a methane fermentation biogas plant in University of Miyazaki. In this study, bacterial community structures of eubacteria and archaebacteria were investigated for methane fermentation liquid and swine slurry by clone library analysis of environmental DNA targeting l6S rRNA genes. Phylogenetic tree by neighbor-joining method was constructed based on the ClustalW alignment result of the sequence data about 730 bases and the database sequences by BLAST search. In eubacteria Family Clostridiaceae clones occupied majority in the slurry and the occupancy rate further increased in the fermentation liquid. Most eubacteria except for Family Clostridiaceae, decreased the occupancy rate, and the diversity index of the eubacteria also decreased. In archaebacteria, the community structure of the detected methane fermentation archaebacterium was changed. The dominance of Methanocorpusculum and Methanoculleus became large and the diversity index of a methane fermentation archaebacteria increased. From these results it was thought that the major bacteria in methane fermentation liquid and swine slurry could be clarified by difference of population of various microbes., 家畜排泄物は土壌改良資材や肥料製造のためのバイオマス系資源として注目されており, その処理方法としてコンポスト化の他, メタン発酵処理が注目されている. 宮崎大学に設置された中温性バイオガスプラントから採取したメタン発酵消化液に関するこれまでの研究で, 病原微生物の存在は確認されなかった. 本研究では, メタン発酵消化液とその原料中の微生物群集構造を明らかにするために, 16S rRNA遺伝子をターゲットとしたeDNAのクローンライブラリー解析によって, 真正細菌と古細菌の群集構造を調査した. 得られた16S rRNA遺伝子配列の5'末端から約730塩基の相同性検索をBLASTによって行った. さらに得られた配列データとデータベースから抽出した配列データを基にClustalWによるアライメントの後, 近隣結合法による系統樹の構築を行ない, 検出された微生物の16S rRNA遺伝子の分類を行った. その結果, 真正細菌群集において, Clostridiaceae科がスラリーで優占しており, 消化液でその優占性はさらに上がり, 高い占有率を示した.  Clostridiaceae科を除く微生物に関しては, 多くが, その占有率を下げており, 真正細菌群集の多様性指数は大きく低下していた.  一方, 古細菌群集においては, 検出されたメタン発酵古細菌すべて,その占有率を変化させており, 発酵過程において, Methanocorpusculum, Methanoculleusが優先化し, Methanogenium, Methanospirillum, Methanosaeta, Methanosarcinaも一定の占有率を獲得し, メタン発酵古細菌群集の多様性指数が高まったと考えられた. 以上, 豚糞尿スラリーおよびメタン発酵消化液における各種微生物の占有率の変化を検出することにより, メタン発酵消化液の主要な微生物群集構造を明らかに出来たと考えられた.},
 pages = {19--28},
 title = {豚糞尿スラリーを原料としたメタン発酵消化液の微生物群集構造},
 volume = {59},
 year = {2013},
 yomi = {サエキ, ユウイチ and ソノダ, リョウイチ and シロ, ソウキチ and ヤノ, ツバサ and アカギ, イサオ and ヤマモト, アキヒロ and スギモト, ヤスヒロ and ソノダ, リョウイチ and シロ, ソウキチ and ヤノ, ツバサ and アカギ, イサオ}
}